MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Singulisphaera acidiphila DSM 18658 plasmid pSINAC01

Total Repeats: 952

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019893	CAA	2	6	1381	1386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430740945
2	NC_019893	GTT	2	6	1454	1459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430740945
3	NC_019893	AGT	2	6	1531	1536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430740945
4	NC_019893	GAT	3	9	1628	1636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430740945
5	NC_019893	CGG	2	6	1637	1642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430740945
6	NC_019893	GAT	2	6	1831	1836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430740945
7	NC_019893	CAC	2	6	1991	1996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430740945
8	NC_019893	CG	3	6	2164	2169	0 %	0 %	50 %	50 %	430740945
9	NC_019893	AGT	2	6	2239	2244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430740945
10	NC_019893	GGCTC	2	10	2246	2255	0 %	20 %	40 %	40 %	430740945
11	NC_019893	CGA	2	6	2263	2268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740945
12	NC_019893	GTCG	2	8	2287	2294	0 %	25 %	50 %	25 %	430740945
13	NC_019893	GTT	2	6	2306	2311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430740945
14	NC_019893	TCA	2	6	2329	2334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430740945
15	NC_019893	CG	3	6	2343	2348	0 %	0 %	50 %	50 %	430740945
16	NC_019893	GAT	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430740945
17	NC_019893	C	7	7	2411	2417	0 %	0 %	0 %	100 %	430740945
18	NC_019893	AGT	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430740945
19	NC_019893	AGA	2	6	2695	2700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430740945
20	NC_019893	GGA	2	6	2890	2895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430740946
21	NC_019893	GCC	2	6	2902	2907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740946
22	NC_019893	C	6	6	2916	2921	0 %	0 %	0 %	100 %	430740946
23	NC_019893	TTG	2	6	2989	2994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430740946
24	NC_019893	GAG	2	6	3052	3057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430740946
25	NC_019893	GTC	2	6	3073	3078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740946
26	NC_019893	GAT	2	6	3094	3099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430740946
27	NC_019893	TTA	2	6	3152	3157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430740946
28	NC_019893	GGT	2	6	3168	3173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430740946
29	NC_019893	GCCA	2	8	3243	3250	25 %	0 %	25 %	50 %	430740946
30	NC_019893	AGC	2	6	3278	3283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740946
31	NC_019893	CTG	2	6	3307	3312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740946
32	NC_019893	GAC	2	6	3313	3318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740946
33	NC_019893	AGTTC	2	10	3327	3336	20 %	40 %	20 %	20 %	430740946
34	NC_019893	CGT	2	6	3367	3372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740946
35	NC_019893	CAG	2	6	3384	3389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740946
36	NC_019893	CTTC	2	8	3474	3481	0 %	50 %	0 %	50 %	430740946
37	NC_019893	GTA	2	6	3517	3522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430740946
38	NC_019893	CGG	2	6	3560	3565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430740946
39	NC_019893	CAA	2	6	3595	3600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430740946
40	NC_019893	CCGA	2	8	3627	3634	25 %	0 %	25 %	50 %	430740946
41	NC_019893	ACG	2	6	3699	3704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740946
42	NC_019893	GCA	2	6	3726	3731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740946
43	NC_019893	GAC	2	6	3732	3737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740946
44	NC_019893	GCTG	2	8	4020	4027	0 %	25 %	50 %	25 %	430740946
45	NC_019893	AATG	2	8	4051	4058	50 %	25 %	25 %	0 %	430740946
46	NC_019893	GAA	2	6	4074	4079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430740946
47	NC_019893	AGCC	2	8	4136	4143	25 %	0 %	25 %	50 %	430740946
48	NC_019893	CATG	2	8	4299	4306	25 %	25 %	25 %	25 %	430740946
49	NC_019893	GACG	2	8	4325	4332	25 %	0 %	50 %	25 %	430740947
50	NC_019893	CGA	2	6	4349	4354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740947
51	NC_019893	GAA	2	6	4358	4363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430740947
52	NC_019893	GCT	2	6	4370	4375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740947
53	NC_019893	GGAA	2	8	4464	4471	50 %	0 %	50 %	0 %	430740947
54	NC_019893	ACTT	2	8	5196	5203	25 %	50 %	0 %	25 %	430740948
55	NC_019893	GCG	2	6	5249	5254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430740948
56	NC_019893	CGC	2	6	5424	5429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740948
57	NC_019893	AAGCG	2	10	5550	5559	40 %	0 %	40 %	20 %	430740948
58	NC_019893	GCG	2	6	5613	5618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430740948
59	NC_019893	CGGC	2	8	5713	5720	0 %	0 %	50 %	50 %	430740948
60	NC_019893	GGA	2	6	6046	6051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430740948
61	NC_019893	CGG	2	6	6086	6091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430740948
62	NC_019893	AG	3	6	6125	6130	50 %	0 %	50 %	0 %	430740948
63	NC_019893	GCC	2	6	6213	6218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740948
64	NC_019893	ACCC	2	8	6262	6269	25 %	0 %	0 %	75 %	430740948
65	NC_019893	TTGCA	2	10	6364	6373	20 %	40 %	20 %	20 %	430740948
66	NC_019893	ATC	2	6	6390	6395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430740948
67	NC_019893	CGA	2	6	6508	6513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740948
68	NC_019893	AAG	2	6	7316	7321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430740949
69	NC_019893	CCA	2	6	7348	7353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430740949
70	NC_019893	TCC	2	6	7389	7394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430740949
71	NC_019893	TGG	2	6	7395	7400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430740949
72	NC_019893	CGA	2	6	7492	7497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740949
73	NC_019893	CCG	2	6	7688	7693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740949
74	NC_019893	TG	3	6	7704	7709	0 %	50 %	50 %	0 %	430740949
75	NC_019893	TGG	2	6	7722	7727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430740949
76	NC_019893	CGC	2	6	7783	7788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740949
77	NC_019893	TCGA	2	8	7799	7806	25 %	25 %	25 %	25 %	430740949
78	NC_019893	CTT	2	6	7849	7854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430740949
79	NC_019893	TCGC	2	8	7874	7881	0 %	25 %	25 %	50 %	430740949
80	NC_019893	CG	3	6	7910	7915	0 %	0 %	50 %	50 %	430740949
81	NC_019893	GTC	2	6	7994	7999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740949
82	NC_019893	CGG	3	9	8016	8024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430740949
83	NC_019893	TGA	2	6	8047	8052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430740949
84	NC_019893	CGA	2	6	8083	8088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740949
85	NC_019893	GAG	2	6	8092	8097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430740949
86	NC_019893	CGA	2	6	8127	8132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740950
87	NC_019893	AATC	2	8	8139	8146	50 %	25 %	0 %	25 %	430740950
88	NC_019893	GCCT	2	8	8165	8172	0 %	25 %	25 %	50 %	430740950
89	NC_019893	CAAC	2	8	8280	8287	50 %	0 %	0 %	50 %	430740950
90	NC_019893	AGC	2	6	8339	8344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740950
91	NC_019893	CGT	4	12	8397	8408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740950
92	NC_019893	GCC	2	6	8428	8433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740950
93	NC_019893	CGT	2	6	8463	8468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740950
94	NC_019893	GGA	2	6	8502	8507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430740950
95	NC_019893	CCGA	2	8	8541	8548	25 %	0 %	25 %	50 %	430740950
96	NC_019893	GTCG	2	8	8688	8695	0 %	25 %	50 %	25 %	430740950
97	NC_019893	CGA	2	6	8742	8747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740950
98	NC_019893	CGC	2	6	8769	8774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740950
99	NC_019893	GGC	2	6	8778	8783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430740950
100	NC_019893	CCG	2	6	8796	8801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740950
101	NC_019893	CGA	2	6	8802	8807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740950
102	NC_019893	ACC	2	6	8851	8856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430740950
103	NC_019893	GAC	2	6	8917	8922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740950
104	NC_019893	AAG	2	6	8977	8982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430740950
105	NC_019893	CCA	2	6	9024	9029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430740951
106	NC_019893	GCC	2	6	9051	9056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740951
107	NC_019893	TCT	2	6	9109	9114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430740951
108	NC_019893	CGT	2	6	9175	9180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740951
109	NC_019893	GGC	2	6	9194	9199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430740951
110	NC_019893	TCG	2	6	9237	9242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740951
111	NC_019893	CGA	2	6	9252	9257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740951
112	NC_019893	CTC	2	6	9272	9277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430740951
113	NC_019893	GCC	2	6	9279	9284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740951
114	NC_019893	CAA	2	6	9373	9378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430740951
115	NC_019893	TCC	2	6	9457	9462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430740951
116	NC_019893	CGG	2	6	9487	9492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430740951
117	NC_019893	TCC	2	6	9546	9551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430740951
118	NC_019893	CTC	2	6	9632	9637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430740951
119	NC_019893	GCT	2	6	9664	9669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740951
120	NC_019893	CTC	2	6	9674	9679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430740951
121	NC_019893	GTC	2	6	9825	9830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740951
122	NC_019893	G	6	6	9934	9939	0 %	0 %	100 %	0 %	430740951
123	NC_019893	GCCG	2	8	9975	9982	0 %	0 %	50 %	50 %	430740951
124	NC_019893	GTT	2	6	10052	10057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430740951
125	NC_019893	CCA	2	6	10061	10066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430740951
126	NC_019893	CCG	2	6	10121	10126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740951
127	NC_019893	GCCA	2	8	10147	10154	25 %	0 %	25 %	50 %	430740951
128	NC_019893	AGC	2	6	10155	10160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740951
129	NC_019893	TTG	2	6	10206	10211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430740951
130	NC_019893	TCG	2	6	10248	10253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740951
131	NC_019893	GCC	2	6	10300	10305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430740951
132	NC_019893	GC	3	6	10315	10320	0 %	0 %	50 %	50 %	430740951
133	NC_019893	GGT	2	6	10355	10360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430740951
134	NC_019893	CAG	2	6	10963	10968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740952
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136	NC_019893	GGA	2	6	12308	12313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430740953
137	NC_019893	TGA	2	6	12353	12358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430740953
138	NC_019893	TCC	2	6	12365	12370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430740953
139	NC_019893	GCGAT	2	10	12460	12469	20 %	20 %	40 %	20 %	430740953
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156	NC_019893	CGG	2	6	13344	13349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430740954
157	NC_019893	CTC	2	6	13358	13363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430740954
158	NC_019893	GC	3	6	13399	13404	0 %	0 %	50 %	50 %	430740954
159	NC_019893	TCG	2	6	13431	13436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430740954
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256	NC_019893	CGG	2	6	19355	19360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430740958
257	NC_019893	C	6	6	19423	19428	0 %	0 %	0 %	100 %	430740958
258	NC_019893	GGAACC	2	12	19436	19447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740958
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260	NC_019893	ACC	2	6	19693	19698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430740958
261	NC_019893	GCTT	2	8	19732	19739	0 %	50 %	25 %	25 %	430740958
262	NC_019893	GGC	2	6	19776	19781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430740958
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264	NC_019893	GAA	2	6	19836	19841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430740958
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381	NC_019893	C	6	6	26744	26749	0 %	0 %	0 %	100 %	430740962
382	NC_019893	CGA	2	6	26832	26837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430740962
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385	NC_019893	TCA	2	6	26967	26972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430740962
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482	NC_019893	GCCG	2	8	32315	32322	0 %	0 %	50 %	50 %	430740965
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